Un informe de fiscalización digital del Jurado Nacional de Elecciones (JNE), emitido un mes antes de la elección, detectó graves riesgos de ciberseguridad en la Solución Tecnológica de Apoyo al Escrutinio (STAE) de la Oficina Nacional de Procesos Electorales (ONPE). El documento advirtió vulnerabilidades críticas que ponían en riesgo la integridad y confidencialidad de la información electoral. Entre los hallazgos más alarmantes se encuentra la facilidad para clonar el dispositivo USB-STAE, que funcionaba como llave de acceso, permitiendo la suplantación de identidad de presidentes de mesa. Asimismo, el análisis del código fuente identificó trece observaciones, como la exposición de contraseñas institucionales y una función que permitía borrar información electoral. Debido a estas fallas de seguridad y a los problemas operativos registrados durante la jornada, el JNE anunció que el sistema STAE no se utilizará en la segunda vuelta, retornando al escrutinio manual, y se ha solicitado una auditoría informática integral.