François Bonnardel décrit 2025 comme « la pire année de sa vie », marquée par des mensonges présumés concernant le fiasco de la plateforme SAAQclic et son exclusion du Conseil des ministres. En tant que ministre des Transports, il a été confronté à un dépassement de coûts de 500 millions de dollars révélé en février 2025, affirmant qu'on lui avait caché la vérité. Le stress et le doute ont été constants, exacerbés par le témoignage de l'ex-PDG de la SAAQ, Denis Marsolais, qui l'a accusé d'avoir été informé des dépassements de coûts. Bonnardel a dû préparer son témoignage devant la commission d'enquête publique pendant sa lune de miel en France, rentrant juste à temps pour témoigner le lendemain, souffrant du décalage horaire. Bien que le rapport Gallant ait principalement blâmé les dirigeants de la SAAQ, Bonnardel a été écarté du cabinet en septembre 2025, une décision qu'il a qualifiée de "gifle". Il admet porter une "grosse cicatrice" de cette période difficile, mais souligne le soutien de sa femme, Joannie Proulx.