La segunda vuelta electoral en La Libertad se vio empañada por la detección de 41 cédulas de votación marcadas en dos locales de votación, una en Florencia de Mora, Trujillo, y otra en Chao, Virú. El Ministerio Público de La Libertad está investigando estos hallazgos, que incluyen 38 cédulas marcadas en la institución educativa Benjamín Carson y tres en la San Juan Bautista. Un elector denunció haber recibido hasta dos cédulas marcadas. Además de estas irregularidades, la jornada electoral en la región, vigilada por numerosos fiscales y voluntarios, también registró cinco detenciones (suplantación, rotura de cédula, ley seca) y retrasos en la instalación de mesas, especialmente en Pataz, aunque la ONPE afirmó que todas se instalaron antes de las 10 a.m. La Defensoría del Pueblo lamentó la falta de orientadores en centros de votación importantes.