La jornada electoral del 12 de abril se vio empañada por un fallo sin precedentes de la ONPE, que impidió el voto a 63.300 ciudadanos en Lima Sur debido a la no distribución de material electoral a 15 centros de votación, afectando 211 mesas. El jefe de la ONPE, Piero Corvetto, reconoció la falla, atribuyéndola a incumplimientos de la empresa Servicios Generales Galaga, pero el problema se extendió a otros centros con retrasos de hasta cuatro horas, provocando que miles de electores se retiraran sin votar. Expertos como Natale Amprimo, Delia Muñoz y Alejandro Rospigliosi critican la negligencia, cuestionan la legitimidad del proceso y sugieren la renuncia de Corvetto y del presidente del Jurado Nacional de Elecciones, Roberto Burneo, ante la falta de garantías para una eventual segunda vuelta. La Fiscalía y la Policía Anticorrupción investigan el incidente.